6️⃣蛋白质序列的功能信息分析1:基于蛋白质基序motif |
您所在的位置：网站首页 › 衬衣功能 信息分析 › 6️⃣蛋白质序列的功能信息分析1:基于蛋白质基序motif |
6️⃣蛋白质序列的功能信息分析1:基于蛋白质基序motif
|
序列比对和序列特征分析总目录 蛋白质具有多种生物学功能，具体可参照《生物化学》。蛋白质若发挥生物学功能，须以空间结构形式。而蛋白质多肽链一旦合成，即可在其他物质协助下，自然折叠，形成一定的空间构象。 1 如果两种蛋白质一级结构相似，那么其空间结构和功能也相似，也有例外。2 分子进化角度，来自不同种属生物体的同一功能的蛋白质，进化位置距离 越近，那么他们一级结构的差别越小。因为蛋白质的空间结构是发挥功能的基础，凡是能影响蛋白质构象的物化和生物因素等，均可影响其功能。 蛋白质所具有的生物学功能常与一些特殊的结构有关，如特定的基序（又叫模体，motif）和结构域（domain）。具有相同基序或结构域的蛋白质可归为一大类，叫超家族（super family）。 依照蛋白质序列特征进行功能预测，主要有以下几种方法： 1 基于蛋白质基序2 基于结构域3 基于同源性搜索基于蛋白质motifmotif是指与蛋白质特定功能相关，具有特定的氨基酸排列顺序的片段。如锌指结构 数据库PROSITE：Database of protein domains, families and functional sites截止今天，20190202，PROSITE contains 1821 documentation entries, 1310 patterns, 1232 profiles and 1256 ProRule.  PROSITE PROSITE可以做什么可以通过蛋白的UniProtKB中的ID，PDB ID或FASTA格式的蛋白质序列在PROSITE中搜索，判断该序列包含的功能位点，从而推测其可能属于哪个蛋白质家族。 还是以HGFAC为例，其UniProtKB ID 为Q04756详细结果页面  结果1  结果2 |
【本文地址】
今日新闻 |
推荐新闻 |